Dalam upaya penyaringan calon mahasiswa pada program doktor Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Mulawarman, maka dalam tes seleksi dilakukan dengan beberapa tahapan, diantaranya tes kemampuan umum, kuantitatif, aritmatika dan Kemampuan Bahasa Inggris.
Selain itu juga Program doktor melakukan tes wawancara untuk lebih mengetahui potensi dan minat para calon mahasiswa Doktor Ilmu Manajemen dan Doktor Ilmu Ekonomi.
